Seminarium Zakładu Biofizyki

Receptory sprzężone z białkiem G (GPCR) stanowią największą znaną rodzinę białek transbłonowych w ludzkim genomie. W ostatnim czasie proces dimeryzacji GPCR jest intensywnie badany, a otrzymywane dane doświadczalne sugerują, że receptory opioidowe, należące do tej rodziny, tworzą in vivo funkcjonalne dimery. Wobec tego zrozumienie zjawiska dimeryzacji może prowadzić do stworzenia precyzyjnych terapii celowanych na wybrany rodzaj dimeru. By zbadać ten proces, zastosowano symulacje gruboziarnistej dynamiki molekularnej (CG MD). Uzyskane tą metodą struktury homodimerów receptorów opioidowych oraz ich geometryczna charakterystyka zostaną przedstawione podczas seminarium.

G-protein coupled receptors (GPCRs) constitute the largest known transmembrane receptor protein family in the human genome. Recently, the GPCRs dimerization is intensely investigated and the resulting experimental results suggest that the opioid receptors, among other GPCR family members, form functional dimers in vivo. Thus, the understanding of dimerization may potentially lead to pharmacological therapies precisely targeted at selected dimer type. To investigate this phenomena, coarse grained molecular dynamics (CG MD) simulations were performed. The opioid receptor homodimer structures obtained from CGMD simulations and their geometry characterization will be presented.